J Comput Biol: En ny metod för att förutsäga målet om antivirala läkemedel eller vacciner

En ny metod för att förutsäga de mest lovande antivirala läkemedlen eller vaccinmålen är baserad på de konformationella förändringarna som virala glykoproteiner upplever under igenkänning och bindning till värdceller. Denna prediktionsmetod är inriktad på vätebindningen i huvudkedjan med det högsta fria energimotivet. Relaterade forskningsresultat publiceras i Journal of Computational Biology, som är en vetenskaplig granskad tidskrift publicerad av Mary Ann Liebert.

Robert Penner är ordförande för Rene Thom från franska institutet för högre utbildning (Bures-sur-Yvette) och UCLA matematisk biologi. Han är författaren till denna artikel med namnet 0010010 quot; Backbone Free Energy Estimator tillämpas på virala glykoproteiner 0010010 quot;

Bildkälla: Mary Ann Liebert, Inc., förlag

När viruset kommer in i värdcellen och absorberas genomgår viruset vanligtvis kraftig rekombination och bildar ett fusions- / infiltreringsmotiv. Penner föreslog en allmän metod för att förutsäga mycket konformationellt aktiva rester från den tredimensionella strukturen av virala glykoproteiner. Metoden inkluderar analys av vätebindningarna i proteinet och beräkning av de fria energiförskjutningarna för motsvarande funktioner för att bestämma områden där konformationell förändring mest sannolikt kommer att inträffa. Metoden som föreslås i detta dokument används för närvarande för spikglykoproteinet från SARS CoV-2, vilket kan orsaka COVID-19.

Misha Gromov från Institute of Advanced Science och New York University sa: 0010010 quot; En matematisk idé leder direkt till en praktisk betydelse, vilket helt enkelt är ett mirakel, men belöningen är enorm eftersom den inträffar i Maxwell {{1 }} # 39; s elektromagnetiska fältteori - det ger radio och TV, öppnar dörren till teoretiska beräkningar i vår digitala värld. 0010010 quot; Han är en berömd matematiker och Abelprisvinnare (även känd som Nobelpriset i matematik). 0010010 quot; Först när dess författare är en framstående matematiker men också har en bred vetenskaplig horisont, är en sådan idé möjlig, och detta är sällsynt bland de bästa matematikerna i vår tid. Robert Penner är en så sällsynt matematiker, han fann att metoden med proteinstruktureringsmönster skiljer sig från någon annan i världen, och proteinstruktureringsmönstret är resultatet av rent matematiskt tänkande. Denna metod kommer sannolikt att spela en roll och påskynda utvecklingen av antivirusläkemedel eller vacciner. Men bara experiment kan bevisa detta. 0010010 citat (Bioon.com)

källa: