COVID-19 detektionstips

För att stödja upptäckten av nya coronavirus (COVID-19) och vaccin forskning och utveckling, den amerikanska Centers for Disease Control and Prevention (CDC) och den kinesiska regeringen har avslutat sekvensering av den nya coronavirus genomet och lämnade in resultaten till den amerikanska NCBI GenBank® databas ]. Nyligen har IDT fått förfrågningar från forskare runt om i världen om det nya coronavirus detektionssatsen. Följande är en kort beskrivning.

AMERIKANSKA Centers for Disease Control and Prevention

U.S. Centers for Disease Control and Prevention Test Kit * Riktar sig till olika platser på COVID-19 nucleocapsid protein gen (N-gen). De tre uppsättningar av primers / sonder i detta kit måste köras samtidigt med den interna kontrollen riktar den mänskliga RNase P genen. Totalt 4 qPCR-tester krävs för varje patientprov.

1. Detektionssatsen använder en qPCR-reaktion i ett steg (det vill än omvänd transkription och efterföljande qPCR-reaktioner slutförs i samma steg).

2. Alla 3 N-gentester kan endast betraktas som ett positivt resultat när Cq<>

3. Den interna kontrollreaktionen hos RNase P är nyckeln. Cq> 35 innebär att provextraktionen inte är bra och att försöket måste upprepas.

Se de senaste amerikanska centra för sjukdomsbekämpning och förebyggande COVID-19 RT-PCR Test Method Laboratory Guide för relevanta dokument och experimentella protokoll.

Jämförelse med andra testsatser

Världshälsoorganisationen (WHO)

Världshälsoorganisationens experimentella program skiljer sig från det amerikanska experimentella programmet Centers for Disease Control and Prevention. Världshälsoorganisationen rekommenderar tre qPCR-reaktioner för att bekräfta om COVID-19 är infekterad. Även om detta är en komplett uppsättning experimentella protokoll, det finns ingen AMERIKANSK CDC testmetod som är snabbare eftersom det kräver tre på varandra följande tester och ett positivt resultat måste observeras före nästa test. Det experimentella protokollet testas i följande ordning:

1. Coronavirus E-gen

2. RdRP gen: inriktning SARS coronavirus och andra bat-associerade coronavirus

3. RdRP gen: inriktning COVID-19

Kinesiska Center for Disease Control and Prevention

Detektionssatsen för det kinesiska centret för sjukdomsbekämpning och förebyggande rekommenderar användning av 2 uppsättningar av primers / sonder. Grupp 1 mål ORF 1ab, och grupp 2 används för att bekräfta N-genen i COVID-19.

Kontrollgrupp

Preliminär elektronisk simulering analys visar att kombinationen av IDT N-gen positiv kontroll mall ** och den amerikanska CDC testkit liknar användningen av primer / sond uppsättningar av den kinesiska CDC, det thailändska hälsoministeriet, och HKU De resultat som erhållits genom experimentet är konsekventa. Naturligtvis är detta baserat på elektronisk simulering forskning, och det rekommenderas att användarna kontrollera det valda kitet i sitt eget laboratorium.

För mer information, besök www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents